Dans Mercury, le joueur ne contrôle pas directement la petite boule, mais il la fait glisser en inclinant le plateau de jeu avec le stick, pour accomplir une multitude d'objectifs dans la limite de temps impartie. Etant donnée la texture particulière du mercure liquide, toute l'astuce consistera à apprivoiser l'inertie de la petite boule, mais aussi sa propension à se scinder en plusieurs parties lorsqu'un obstacle lui résiste. Un mal qui sera parfois nécessaire, puisque la boule peut changer de couleur en passant sur des ateliers de peinture. Or, mélanger plusieurs teintes en réunissant les mercures éparpillés sera l'unique moyen d'obtenir certains dégradés pour ouvrir telle porte ou allumer telle balise de la couleur correspondante. De niveau en niveau, le joueur apprendra à maîtriser les tapis roulants, à éviter les ennemis mange-boule et les pylônes électriques, à prendre de l'élan pour grimper une pente ou à gérer plusieurs boules de mercure à la fois, en zappant de l'une à l'autre avec la croix directio Abréger